GMP车间净化工程材料要耐清洗和消毒、无裂缝、表面平整光滑、接口严密，不得有颗粒性物质脱落。另外，对某种材料的选用，除了要看该材料能否满足GMP要求外，还要考虑材料的使用寿命，施工简便与否，价格来源等各方面。施工的时候有高温、高湿、臭味和气体（包括蒸汽及有毒气体）或粉尘产生（如磨粉工段）的场所不得使用循环风，应有排风和适当的处理，排风应符合相关国家标准的要求。
GMP净化车间的清洁净化工程设备净化原理：气流超效率空气处理空调中效率空气处理风扇空气供应净化管道空气排放口洁净室除尘(细菌)通风钳室外空气、超效率空气处理。重复以上过程可以达到净化目的。车间人员和材料进入清洁工厂需要有各自的净化室和设施，净化室的设置要求需要符合生产区的清洁水平。人力和材料使用的电梯要分开，电梯要尽量不要安装在干净的区域，如果需要安装，电梯前要安装空气闸阀。
GMP车间净化工程对门窗要求：
洁净车间（洁净室）用的门要求平整、光滑、易清洁、造型简单、不设门槛，并向洁净度高的方向开启。宜加闭门器，并有密闭条，以保证空气流组织和房间压差控制。洁净室的门不应采用木质材料，以免发霉、长菌或变形。
洁净车间（洁净室）用的窗要求密闭、造型简单、平整、不易积灰、易于清洗，与内墙面宜平整，不留窗台（如有窗台宜成斜角），不应采用木质材料。凡空调区与非空调区之间隔墙上的窗要设双层窗，其中至少一层为固定窗。
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